Povestea noastra incepe un an după link-ul au învins Ganondorf şi Midna s-a întors la domeniul de amurg. Link-ul a fost chemat la Castelul Hyrule unde Zelda spune Link care în vis i sa spus de artefact antic, care era stocată în Templul de timp şi vrea el să se regăsească.